Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StambpQ9CQ26 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StambpQ9CQ26 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms