Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpd52l3Q9CQ14 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms