Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Commd4Q9CQ02 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Commd4Q9CQ02 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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