Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cmc1Q9CPZ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms