Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CPS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms