Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl17Q9CPR4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms