Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NsmfQ99NF2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NsmfQ99NF2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms