Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brms1Q99N20 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brms1Q99N20 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms