Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac9Q99N13 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms