Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrtQ99MR6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms