Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms