Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sh3bp5lQ99LH9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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