Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp16Q99LG0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp16Q99LG0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms