Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pagr1aQ99L02 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pagr1aQ99L02 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms