Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99KU6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q99KU6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q99KU6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q99KU6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q99KU6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99KU6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms