Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hps4Q99KG7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms