Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlgn1Q99K10 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms