Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Higd1bQ99JY6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Higd1bQ99JY6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms