Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pacsin3Q99JB8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms