Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ddb2Q99J79 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ddb2Q99J79 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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