Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms