Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apobec3Q99J72 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms