Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cldn16Q925N4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cldn16Q925N4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cldn16Q925N4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Cldn16Q925N4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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