Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrif1Q923B3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms