Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf3Q922U1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms