Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb6Q922F4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms