Protein–RNA interactions for Protein: Q921L3

Tmco1, Calcium load-activated calcium channel, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco1Q921L3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco1Q921L3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms