Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims2Q91XD2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lims2Q91XD2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms