Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms