Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms