Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SelenomQ8VHC3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SelenomQ8VHC3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms