Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc115Q8VE99 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc115Q8VE99 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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