Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms