Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms