Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FggQ8VCM7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FggQ8VCM7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms