Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nae1Q8VBW6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nae1Q8VBW6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms