Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms