Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casc3Q8K3W3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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