Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OptnQ8K3K8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OptnQ8K3K8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms