Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brd3Q8K2F0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms