Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c1Q8K284 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms