Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf628Q8CJ78 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms