Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trip10Q8CJ53 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms