Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh4a1Q8CHT0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms