Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Csnka2ipQ8CH19 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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