Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hpf1Q8CFE2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hpf1Q8CFE2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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