Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms