Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc28bQ8CEG5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc28bQ8CEG5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc28bQ8CEG5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28bQ8CEG5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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