Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms