Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Samd4aQ8CBY1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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